获取Targetsite profile
<p>[TOC]</p>
<h5>简要描述</h5>
<ul>
<li>获取Targetsite profile</li>
</ul>
<h5>请求URL</h5>
<ul>
<li><code>http://119.136.27.201:3200/target/site/profile</code>
<h5>请求方式</h5></li>
<li>GET</li>
</ul>
<h5>参数</h5>
<table>
<thead>
<tr>
<th style="text-align: left;">参数名</th>
<th style="text-align: left;">必选</th>
<th style="text-align: left;">类型</th>
<th>说明</th>
</tr>
</thead>
<tbody>
<tr>
<td style="text-align: left;">gene_id</td>
<td style="text-align: left;">是</td>
<td style="text-align: left;">int</td>
<td>靶点id</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">region</td>
<td style="text-align: left;">是</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>region 编号，例如"chr8:127736624-127737686"</td>
</tr>
</tbody>
</table>
<h5>返回示例</h5>
<pre><code>{
'data': {
'region': {
'Gene Symbol': 'MYC',
'Target Site Name': None,
'Region': 'chr8:127736624-127737686',
'Type': 'Alternative Splicing Site',
'Sequence (Donor)': 'GGGGGTGGGG',
'PTC Position': '127736699',
'Strand': '+',
'Exon Annotation Info': 'ENST00000621592.8/I1/3'
},
'chart_table': [{
'compound': 'RC00014586_3µM_24hr-RSQP0083',
'htt_activity': 18.0,
'compound_url': 'https://revirtx.benchling.com/revirtx/f/lib_Nz4dgQWg-registry/mol_mPWBKMqK-rc00014586/edit',
'PSI delta log10qvalue': 1.0,
'diffExon log2fc log10qvalue': 0.008,
'Gene expression log2FC log10qvalue': 0.029,
'Delta psi (Down Intron/ Reference Intron)': -0.007,
'Delta psi (Up Intron/ Alternative Intron)': 0.007,
'CHX Delta psi (Down Intron/ Reference Intron)': None,
'CHX Delta psi (Up Intron/ Alternative Intron)': None,
'diffExon log2FC': -0.016,
'diffExon padj': 0.981,
'CHX diffExon log2FC': 0.37,
'CHX diffExon padj': 0.748,
'diffGene log2FC': -0.004,
'diffGene padj': 0.935,
'CHX diffGene log2FC': 1.881,
'CHX diffGene padj': 0.0,
'sort': -0.0159624881501956
}]
},
'code': 200,
'message': 'success'
}</code></pre>
<h5>返回参数说明</h5>
<table>
<thead>
<tr>
<th style="text-align: left;">参数名</th>
<th style="text-align: left;">类型</th>
<th>说明</th>
</tr>
</thead>
<tbody>
<tr>
<td style="text-align: left;">region</td>
<td style="text-align: left;">json</td>
<td>target site profile 表头数据</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">chart_table</td>
<td style="text-align: left;">list</td>
<td>target site profile 图表数据</td>
</tr>
</tbody>
</table>
<h5>备注</h5>
<p>数据格式与 /target/detail/all 接口 treated region 部分返回格式相同，页面重组可以直接套用</p>