获取药物分析结果分布图表数据
<p>[TOC]</p>
<h5>简要描述</h5>
<ul>
<li>获取药物分析结果分布图表数据
<h5>请求URL</h5></li>
<li><code>http://119.136.27.201:3200/drug/discovery/rna_seq/molecules</code>
<h5>请求方式</h5></li>
<li>GET</li>
</ul>
<h5>参数</h5>
<table>
<thead>
<tr>
<th style="text-align: left;">参数名</th>
<th style="text-align: left;">必选</th>
<th style="text-align: left;">类型</th>
<th>说明</th>
</tr>
</thead>
<tbody>
<tr>
<td style="text-align: left;">id</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>图片内选点后将选定的点id传入， 以“,”分隔</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">project</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>表格 project勾选内容, 多选以“,”分隔</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">compound</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>药物编号框内搜索内容, 可以输入编号例如 50,28</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">dose</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>表格 dose 勾选内容, 单选</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">cell_line</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>表格 cell_line 勾选内容, 单选</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">sort</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>排序字段， 可选： ecc50</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">desc</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>是否倒序， 1是， 0否</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">umap_search</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>"Target site"搜索框内内容</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">umap_id</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>"Target site"下umap图选定的点的id， 可多选以”,“分开, 例如： ”3, 66“</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">Cluster Group</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>"Target site"下表格Cluster Group字段筛选值， 可多选以”,“分开, 例如： ”cluster_11,cluster_12“</td>
</tr>
</tbody>
</table>
<h5>返回示例</h5>
<pre><code>{
'data': {
'table': {
'molecules': [{
'id': 193,
'compound': 'RC00000028',
'portfolio': 'RSQP0001',
'project': 'HTT,MSH3,FOXM1',
'ec50': '2.017,1261.0,60.06',
'cell_line': 'HEK293T',
'dose': '3µM',
'scaffold_id': 'SR-001B',
'url': 'https://revirtx.benchling.com/revirtx/f/lib_Nz4dgQWg-registry/mol_18mzbFzq-rc00030184/edit'
}],
'filter': {
'dose': ['3µM'],
'cell_line': ['3µM'],
'project': ['FOXM1', 'MSH3', 'HTT'],
'compound_color': ['MSH3_PE4_minigene_DR', 'HTT_RNAseq', 'MSH3_PE4_minigene_HTS']
},
'total': 1
},
'chart': {
'GeneExpression': [{
'x': -21.416897,
'y': 15.994448,
'id': 193,
&quot;dPSI&quot;: 0,
'tag': 'RC28',
'skip_ratio': 2.1229259172703903,
'scaffold': SR-111',
'is_highlight': True,
'FOXM1_minigene_HTS': True,
'HTT_RNAseq': True,
'MSH3_PE4_minigene_HTS': false,
'MSH3_RNAseq': True,
'MYB_RNAseq': True,
'SMN2_minigene_HTS': True
}],
'Splicing': [{
'x': -15.681424,
'y': 10.386231,
'id': 193,
'tag': 'RC28',
&quot;dPSI&quot;: 0,
'scaffold': SR-111',
'skip_ratio': 2.1229259172703903,
'is_highlight': True,
'FOXM1_minigene_HTS': True,
'HTT_RNAseq': True,
'MSH3_PE4_minigene_HTS': false,
'MSH3_RNAseq': True,
'MYB_RNAseq': True,
'SMN2_minigene_HTS': True
}],
'ChemicalStructure': [{
'x': 0.14936212,
'y': 2.665159,
'id': 193,
'tag': 'RC28',
&quot;dPSI&quot;: 0,
'scaffold': SR-111',
'skip_ratio': 2.1229259172703903,
'is_highlight': True,
'FOXM1_minigene_HTS': True,
'HTT_RNAseq': True,
'MSH3_PE4_minigene_HTS': false,
'MSH3_RNAseq': True,
'MYB_RNAseq': True,
'SMN2_minigene_HTS': True
}],
},
&quot;target_site_chart&quot;: [{
&quot;id&quot;: 0,
&quot;x&quot;: 6.808121,
&quot;y&quot;: 16.722176,
&quot;tag&quot;: &quot;DVL1&quot;,
&quot;cluster_group&quot;: &quot;cluster_11&quot;,
&quot;dPSI&quot;: 0,
&quot;is_highlight&quot;: True
},
{
&quot;id&quot;: 1,
&quot;x&quot;: 16.968786,
&quot;y&quot;: -2.3500016,
&quot;tag&quot;: &quot;FAAP20&quot;,
&quot;cluster_group&quot;: &quot;cluster_11&quot;,
&quot;dPSI&quot;: 0,
&quot;is_highlight&quot;: true
},
{
&quot;id&quot;: 2,
&quot;x&quot;: 10.274142,
&quot;y&quot;: 8.796504,
&quot;tag&quot;: &quot;P3H1&quot;,
&quot;cluster_group&quot;: &quot;cluster_4&quot;,
&quot;dPSI&quot;: 0,
&quot;is_highlight&quot;: true
},
&quot;target_site_table&quot;: [
{
&quot;id&quot;: 0,
&quot;Gene symbol&quot;: &quot;DVL1&quot;,
&quot;Region&quot;: &quot;chr1:1338653-1339287&quot;,
&quot;Strand&quot;: &quot;-&quot;,
&quot;Sequence&quot;: &quot;GCCTGGTGCTCCACGTAAGTGGCAGCTCC&quot;
},
{
&quot;id&quot;: 1,
&quot;Gene symbol&quot;: &quot;FAAP20&quot;,
&quot;Region&quot;: &quot;chr1:2189781-2192845&quot;,
&quot;Strand&quot;: &quot;-&quot;,
&quot;Sequence&quot;: &quot;AGAGGCTGAGGCAGGTGGGTTGCTGGAGC&quot;
},
{
&quot;id&quot;: 2,
&quot;Gene symbol&quot;: &quot;P3H1&quot;,
&quot;Region&quot;: &quot;chr1:42746852-42747253&quot;,
&quot;Strand&quot;: &quot;-&quot;,
&quot;Sequence&quot;: &quot;AGCAGCTCGAGCGGGTGAGAGCAGCTGGT&quot;
},
&quot;cluster_filter&quot;: [&quot;cluster_9&quot;, &quot;cluster_18&quot;, &quot;cluster_4&quot;, &quot;cluster_17&quot;],
&quot;ptc_library&quot;: [
{
&quot;compound&quot;: &quot;RSQP0263_RC00030156_3µM_HEK293T&quot;,
&quot;clusters&quot;: [
{
&quot;cluster&quot;: &quot;cluster_0&quot;,
&quot;value&quot;: 0.0015076837
},
{
&quot;cluster&quot;: &quot;cluster_1&quot;,
&quot;value&quot;: 0.0010000859
}]
},
{
&quot;compound&quot;: &quot;RSQP0698_RC00030131_3µM_HEK293T&quot;,
&quot;clusters&quot;: [
{
&quot;cluster&quot;: &quot;cluster_0&quot;,
&quot;value&quot;: 0.0011641797
},
{
&quot;cluster&quot;: &quot;cluster_1&quot;,
&quot;value&quot;: 0.0021163516
}]
},]
},
'code': 200,
'message': 'success'
}</code></pre>
<h5>返回参数说明</h5>
<table>
<thead>
<tr>
<th style="text-align: left;">参数名</th>
<th style="text-align: left;">类型</th>
<th>说明</th>
</tr>
</thead>
<tbody>
<tr>
<td style="text-align: left;">table</td>
<td style="text-align: left;">json</td>
<td>表格相关数据</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">molecules</td>
<td style="text-align: left;">list</td>
<td>表格内数据</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">filter</td>
<td style="text-align: left;">json</td>
<td>表格可选筛选和范围</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">total</td>
<td style="text-align: left;">int</td>
<td>表格上方显示的总数</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">chart</td>
<td style="text-align: left;">json</td>
<td>图片相关数据</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">GeneExpression</td>
<td style="text-align: left;">list</td>
<td>名称为GeneExpression的图片点数据，SplicingMotif，KANOFeature，ChemicalStructure， SplicingKmer，Splicing 同上</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">x</td>
<td style="text-align: left;">number</td>
<td>横坐标位置</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">y</td>
<td style="text-align: left;">number</td>
<td>纵坐标位置</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">id</td>
<td style="text-align: left;">int</td>
<td>点ID， 界面上鼠标选择点后传参参数</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">tag</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>点显示名称</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">skip_ratio</td>
<td style="text-align: left;">number</td>
<td>用于显示点颜色</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">scaffold</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>用于显示点颜色</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">is_highlight</td>
<td style="text-align: left;">boolean</td>
<td>是否高亮</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">target_site_chart</td>
<td style="text-align: left;">list</td>
<td>targetsite umap分布图数据</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">target_site_table</td>
<td style="text-align: left;">list</td>
<td>targetsite 分布图下表格数据</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">ptc_library</td>
<td style="text-align: left;">list</td>
<td>RNA-directed PTC Library 热力图数据</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">cluster_filter</td>
<td style="text-align: left;">list</td>
<td>targetsite 分布图下表格数据</td>
</tr>
</tbody>
</table>
<h5>备注</h5>
<p>v3.2.5 增加Cluster Group筛选，表格中增加id用于与图中的点对应</p>