Splicing Target Discovery-Compound 单药物详情
<p>[TOC]</p>
<h5>简要描述</h5>
<ul>
<li>获取 Splicing Target Discovery-Compound 单药物详情页
<h5>请求URL</h5></li>
<li><code>http://119.136.27.201:3200/discovery/compound/detail</code>
<h5>请求方式</h5></li>
<li>GET</li>
</ul>
<h5>参数</h5>
<table>
<thead>
<tr>
<th style="text-align: left;">参数名</th>
<th style="text-align: left;">必选</th>
<th style="text-align: left;">类型</th>
<th>说明</th>
</tr>
</thead>
<tbody>
<tr>
<td style="text-align: left;">offset</td>
<td style="text-align: left;">是</td>
<td style="text-align: left;">int</td>
<td>分页偏移量</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">limit</td>
<td style="text-align: left;">是</td>
<td style="text-align: left;">int</td>
<td>分页大小</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">compound_id</td>
<td style="text-align: left;">是</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>药物id，使用discovery/rna_seq 接口中compound_id字段</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">gene</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>gene筛选，多选以“,”分隔</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">order</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>倒序字段，可选："p_value", "q_value", "log2_fold_change", "tpm"</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">desc</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">int</td>
<td>排序是否倒序 1：是， 0：否 默认1</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">log2fc_min</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">number</td>
<td>log2fc筛选，填入”log2 FC >“ 框内的数值</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">log2fc_max</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">number</td>
<td>log2fc筛选，填入”log2 FC <“ 框内的数值</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">q_value</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">number</td>
<td>q_value筛选，填入”q_value <“ 框内的数值</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">p_value</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">number</td>
<td>p_value筛选，填入”p_value <“ 框内的数值</td>
</tr>
</tbody>
</table>
<h5>返回示例</h5>
<pre><code>{
'data': {
'name': 'RC00000028_3µM_24hr-20230405-RSQP0104/SK-N-SH',
'default_genes': 'HTT,MSH3,FGFR3,MYB,FOXM1',
'table': {
'total': 1,
'limit': 1,
'offset': 0,
'genes': [{
'gene': 'HPGD',
'gene_url': &quot;https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=FGD2&quot;,
'open_target_url': 'https://platform.opentargets.org/target/ENSG00000105851',
'ensembl_gene_id': 'ENSG00000164120.14',
'compound_id': 'RC00000050_3µM_24hr-20230509',
'log2_fold_change': -3.487,
'p_value': '2.228e-32',
'qvalue': '5.571e-31',
&quot;tpm_treat&quot;： 0.1,
&quot;tpm_control&quot;： 0.05,
}]
},
'chart': [{
'x-axis': -3.487,
'y-axis': 30.254,
'tag': 'HPGD',
'is_highlight': True
}, {
'x-axis': -3.471,
'y-axis': 4.044,
'tag': 'PDCD6-DT',
'is_highlight': False
}, {
'x-axis': -3.47,
'y-axis': 1.644,
'tag': 'ENSG00000285215',
'is_highlight': False
}, {
'x-axis': -3.462,
'y-axis': 239.443,
'tag': 'MRPS31',
'is_highlight': False
}, {
'x-axis': -3.433,
'y-axis': 3.889,
'tag': 'ENSG00000272986',
'is_highlight': False
}, {
'x-axis': -3.432,
'y-axis': 1.688,
'tag': 'CFAP58-DT',
'is_highlight': False
}, {
'x-axis': -3.366,
'y-axis': 13.265,
'tag': 'PHC1P1',
'is_highlight': False
}, {
'x-axis': -3.365,
'y-axis': 1.486,
'tag': 'CAHM',
'is_highlight': False
}],
'upregulated_chart': 'http://119.136.27.201:15555/rna_seq_dev/result/RSQP0154/11SpliceR_targets/RC00000050_3µM_24hr-DMSO_24hr/selectivity/DEG-up-RC00000050_3µM_24hr-DMSO_24hr-HTT.pdf',
'upregulated_table': {
'(1,2]': '3238',
'(2,3]': '666',
'(3,4]': '252',
},
'downregulated_chart': 'http://119.136.27.201:15555/rna_seq_dev/result/RSQP0154/11SpliceR_targets/RC00000050_3µM_24hr-DMSO_24hr/selectivity/DEG-down-RC00000050_3µM_24hr-DMSO_24hr-HTT.pdf',
'downregulated_table': {
'(0,0.1]': '70',
'(0.1,0.2]': '1208',
'(0.2,0.3]': '1086',
},
'deg_chart': 'http://119.136.27.201:15555/rna_seq_dev/result/RSQP0154/11SpliceR_targets/RC00000050_3µM_24hr-DMSO_24hr/selectivity/DEdonor-RC00000050_3µM_24hr-DMSO_24hr.pdf',
'deg_table': {
'(0,0.1]': '3498',
'(0.1,0.2]': '781',
'(0.2,0.3]': '339',
}
},
'code': 200,
'message': 'success'
}</code></pre>
<h5>返回参数说明</h5>
<table>
<thead>
<tr>
<th style="text-align: left;">参数名</th>
<th style="text-align: left;">类型</th>
<th>说明</th>
</tr>
</thead>
<tbody>
<tr>
<td style="text-align: left;">name</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>页面标题名称</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">table</td>
<td style="text-align: left;">list</td>
<td>表格数据</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">genes</td>
<td style="text-align: left;">list</td>
<td>表格行数据</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">gene_url</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>基因跳转链接</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">chart</td>
<td style="text-align: left;">list</td>
<td>火山图（散点图）数据</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">x-axis</td>
<td style="text-align: left;">number</td>
<td>火山图点x轴坐标</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">y-axis</td>
<td style="text-align: left;">number</td>
<td>火山图点y轴坐标</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">is_highlight</td>
<td style="text-align: left;">boolean</td>
<td>火上图点是否高亮</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">tag</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>火上图高亮点显示名称</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">upregulated_chart</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>Number of genes upregulated 图片链接</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">upregulated_table</td>
<td style="text-align: left;">list</td>
<td>Number of genes upregulated 表格内容, 表格字段和内容由后端控制</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">downregulated_chart</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>Number of genes downregulated 图片链接</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">downregulated_table</td>
<td style="text-align: left;">list</td>
<td>Number of genes downregulated 表格内容</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">deg_chart</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>Number of donors upregulated in DEG 图片链接</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">deg_table</td>
<td style="text-align: left;">list</td>
<td>Number of donors upregulated in DEG 表格内容</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">tpm_treat</td>
<td style="text-align: left;">number</td>
<td>TPM (Compound Treated)</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">tpm_control</td>
<td style="text-align: left;">number</td>
<td>TPM (DMSO)</td>
</tr>
</tbody>
</table>
<h5>备注</h5>
<p>V3.2.2 增加 default_genes 字段， 用于输入用户 wish list 基因, 增加open_target_url用于跳转到open target网站</p>