更新靶点详情
<p>[TOC]</p>
<h5>简要描述</h5>
<ul>
<li>更新靶点详情</li>
</ul>
<h5>请求URL</h5>
<ul>
<li><code>http://119.136.27.201:3200/target/detail</code>
<h5>请求方式</h5></li>
<li>PATCH, PUT </li>
</ul>
<h5>参数</h5>
<table>
<thead>
<tr>
<th style="text-align: left;">参数名</th>
<th style="text-align: left;">必选</th>
<th style="text-align: left;">类型</th>
<th>说明</th>
</tr>
</thead>
<tbody>
<tr>
<td style="text-align: left;">id</td>
<td style="text-align: left;">是</td>
<td style="text-align: left;">int</td>
<td>靶点id</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">ensamble_gene_id</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>转录本基因id</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">function_summary</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>基因功能描述</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">transcript_id</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>转录本</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">genome</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>基因组</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">status</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>靶点研究进度状态</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">view</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">list</td>
<td>查看权限列表</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">type</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>靶点类型: Reviewed 或 Unreviewed</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">name</td>
<td style="text-align: left;">否</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>靶点名称</td>
</tr>
</tbody>
</table>
<h5>返回示例</h5>
<pre><code>{
'data': {
'id': 3,
'gene': 'Aptamer21',
'target_id': 'RT00005',
'type': 'Reviewed',
'date': '2022-02-24',
'view': ['ALL'],
'function_summary': 'description',
'status': 'Reviewed',
'gene_symbol': 'Aptamer21',
'ensamble_gene_id': 'ENST00000360937.12',
'transcript_id': 'ENSG00000002726.12',
'genome': 'hg38-',
'projects': [{
'id': 2,
'project_id': 'Aptamer21_DEL_002',
'target': 'Aptamer21',
'manager': 'Bingying LI',
'technician': ['Miao Zhao', 'Min Wang'],
'protocol': 'version 2',
'library': 'Wuxi',
'status': 'Affinity selection',
'modified': '2022/06/30',
'created': '2022/02/25',
'summary': '',
'type': 'DEL',
'view': ['ALL'],
'protocol_link': 'https://ydrx4o.axshare.com/#id=q47kib&p=del'
}],
'publication': [{
'id': 1,
'name': 'article 001',
'journal': 'CHN',
'authors': '',
'publish_date': '2009-08-08',
'link': '',
'target': 'Aptamer21'
}],
'files': ['test_file.pdf', 'final_prediction_with_ID.sdf'],
'molecules': [{
'formula': 'C21H14FN3O2',
'smiles': 'c1cc(F)ccc1-c(n2)c(n(c23)cccc3)Cn4c(=O)oc(c45)cccc5',
'publication': 'article2602',
'status': 'on-sale',
'assay': 'all'
}],
'disease_section': [{
'id': 1,
'disease_name': 'hyperlipoproteinaemia',
'phenotype': 'The excess fat accumulates in organs such as the spleen and liver, which become abnormally enlarged',
'population_size': '2/1m',
'etiology_organ': 'Liver and brain',
'mechanism': 'FCS is caused by insufficient or impaired function of the enzyme, lipoprotein lipase (LPL)'
}],
'drug_section': [{
'id': 1,
'drug_name': 'VOLANESOR',
'modality': 'ASOBBB',
'moa': 'degradation',
'company': 'Pharmaceuticals',
'clinical_stage': 'Approved (CHN)',
'safety': 'The most common side effects were injection site reactions',
'efficacy': 'participants given volanesorsen had an average 77% reduction',
'drug_bank': 'LINK',
'chembl': 'LINK',
'drug_central': 'LINK'
}],
'evidence': [{
'id': 3,
'genetic_evidence': 'evidence_001',
'rationale_summary': '1. No need for injection',
'evidence_category': 'undefined',
'evidence_status': 'in research',
'evidence_area': '111-222',
'evidence_owner': 'Xing Tang',
'evidence_review': 'url link',
'fad_sheet': 'url link'
}]
},
'code': 200,
'message': 'success'
}</code></pre>
<h5>返回参数说明</h5>
<table>
<thead>
<tr>
<th style="text-align: left;">参数名</th>
<th style="text-align: left;">类型</th>
<th>说明</th>
</tr>
</thead>
<tbody>
<tr>
<td style="text-align: left;">id</td>
<td style="text-align: left;">int</td>
<td>靶点id</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">target_id</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>REVIR靶点编号</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">gene</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>基因名称</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">type</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>靶点类型: Reviewed 或 Unreviewed</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">view</td>
<td style="text-align: left;">list</td>
<td>查看权限列表</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">date</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>靶点添加日期</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">gene_symbol</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>基因名称</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">ensamble_gene_id</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>转录本基因id</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">transcript_id</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>转录本</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">genome</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>基因组</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">function_summary</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>基因功能描述</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">evidence/id</td>
<td style="text-align: left;">int</td>
<td>evidence id</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">genetic_evidence</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>基因学支持</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">rationale_summary</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>基本原理描述</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">evidence_category</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>支持类别</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">evidence_status</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>支持状态</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">evidence_area</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>支持区域</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">evidence_owner</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>拥有者,选择系统用户用户名</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">evidence_review</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>review网址链接</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">fda_sheet</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>fda网址链接</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">view</td>
<td style="text-align: left;">list</td>
<td>查看权限列表</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">projects</td>
<td style="text-align: left;">list</td>
<td>Assay 实验项目列表, 字段说明与获取项目详情相同</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">files</td>
<td style="text-align: left;">list</td>
<td>靶点上传文件名列表</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">molecules</td>
<td style="text-align: left;">list</td>
<td>文献验证的靶点能结合的小分子信息</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">molecules/formula</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>小分子分子式</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">molecules/smiles</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>小分子结构</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">molecules/publication</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>文献名称</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">molecules/status</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>文献小分子阶段</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">molecules/assay</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>文献小分子实验信息</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">disease_section</td>
<td style="text-align: left;">list</td>
<td>靶点相关疾病信息</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">disease_section/id</td>
<td style="text-align: left;">int</td>
<td>疾病id</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">disease_section/disease_name</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>疾病名称</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">disease_section/population_size</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>人群患者比例</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">disease_section/etiology_organ</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>病因器官</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">disease_section/mechanism</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>致病机理</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">drug_section</td>
<td style="text-align: left;">list</td>
<td>靶点相关药物信息</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">drug_section/id</td>
<td style="text-align: left;">int</td>
<td>药物id</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">drug_section/name</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>药物名称</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">drug_section/modality</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>物理疗法</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">drug_section/moa</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>moa</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">drug_section/company</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>制造公司</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">drug_section/clinical_stage</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>临床分期</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">drug_section/safety</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>安全性描述</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">drug_section/efficacy</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>效用描述</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">drug_section/drug_bank</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>drug_bank 网站链接</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">drug_section/chembl</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>chembl 网站链接</td>
</tr>
<tr>
<td style="text-align: left;">drug_section/drug_central</td>
<td style="text-align: left;">string</td>
<td>drug_central 网站链接</td>
</tr>
</tbody>
</table>
<h5>备注</h5>
<p>V4 版本靶点详情接口原V3的 evidence 更改为一对多的关系(同 drug_section/disease_section)
V4 版本增加修改靶点状态</p>